A Universidade Metropolitana de Santos iniciou seu projeto de Educação a Distância com a criação de um núcleo especial, em 2003, que passou a chamar de Unimes Virtual. A proposta, pioneira na Baixada Santista, foi desenvolvida dentro dos mais exigentes padrões de qualidade em EAD, com três fundamentos básicos: infraestrutura tecnológica, qualificação pedagógica e interatividade constante.
Em 2006, a Unimes Virtual obteve do MEC o credenciamento para a oferta de cursos, primeiramente no estado de São Paulo e posteriormente, ampliado para o âmbito nacional. O primeiro processo seletivo foi realizado, em agosto de 2006, com a participação simultânea de mais de 80 polos conveniados em todo o Brasil.
O desenvolvimento de um projeto pedagógico que prioriza a interação entre professores e alunos, aluno e aluno, teve como consequência um modelo interativo com atividades exclusivas da Unimes Virtual: simpósios virtuais, laboratórios virtuais, salas de estágio, atividades complementares focadas na interdisciplinaridade e Educação.
Os professores são mestres e doutores comprometidos com a construção do conhecimento e o compartilhamento de ideias. Os tutores, responsáveis pela interação com os alunos, recebem formação especial e constante, oferecendo assim, orientação cuidadosa e informação atualizada.